歷屆系主任

第一任醫學系主任：郭承統主任 (民國76 年 ~民國 87 年)

第二任醫學系主任：黃秋錦主任 (民國87 年 ~民國 89 年)

第三任醫學系主任：黃燦龍主任 (民國89 年 ~民國97 年)

第四任醫學系主任：方基存主任 (民國97 年 ~民國104年7月)

第五任醫學系主任：周宏學主任 (民國104年8月~民國108年7月)

第六任醫學系主任：謝明儒主任 (民國108年8月~) 

歷屆副系主任

方基存副主任 (民國95 年 ~民國97 年)

周宏學副主任 (民國97 年 ~民國104年7月)

林俊彥副主任 (民國100 年 ~民國104年7月)

劉嘉逸副主任 (民國104年8月~民國109年7月)

吳憲銘副主任 (民國104年8月~民國107年7月)

謝明儒副主任 (民國107年8月~民國108年7月)

張玉喆副主任 (民國108年8月~) 

林蔚然副主任(民國109年8月~)

歷屆醫預科主任

第一任醫預科主任：黃明達教授 (民國87 年 ~民國 89 年)

第二任醫預科主任：張吳名任教授 (民國89 年 ~民國 94 年)

第三任醫預科主任：周淑娥副教授 (民國94 年 ~民國97年)

第四任醫預科主任：鄭授德副教授 (民國97 年 ~民國108年7月)

第五任醫預科主任：吳嘉霖教授 (民國108 年8月 ~)